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计信院前沿学术报告(2018.11-14)

发布时间:2018-11-12 来源:本站原创 作者:本站编辑   浏览次数:

西南大学计信院前沿学术报告

Southwest University IT Faculty Seminar

报告题目:从高维基因组数据中学习  

报告人:寸玉鹏,中国科学院昆明植物研究所研究员

时间:2018年11月14日下午14:30-16:00

地点:25-1314

报告摘要: 现代基因组学技术的发展大大地促进了生物医学的研究和观念,个体化医疗就是在基因组学的影响下发展起来的一种精准医学,从大量特定疾病患者群的分子生物学数据中,发现疾病相关的基因和通路,从而将病因精确到分子水平,并据此对患者制定个体化的治疗方案。新一代高通量测序大大降低了测序的成本,同时极大提高了测序效率。但是却给下游的海量生物数据处理带来巨大的挑战。我将介绍如何机器学习模型和统计建模对海量生物医学数据进行系统地处理、整合、建模、及发掘,从而整合多组学数据用于癌症预后相关基因的发现,和推断癌症发生演化的过程,从加速个性化医疗、基因组医学、及大数据预测科学在未来进准医学的应用。

 

报告人简历: 寸玉鹏,现任中国科学院昆明植物研究所研究员, 2014年在波恩大学的计算生命科学的博士学位;2013年9月进入德国科隆大学转化基因组学系,在Martin Peifer教授和Roman Thomas教授的指导下进行计算基因组学和生物信息学的博士后研究;2018年7月,通过中国科学院"百人计划"技术英才的支持进入中科院昆明植物所组建"iFlora生物信息中心",从事机器学习和计算基因组学的研究。

寸博士主要从事生物统计、机器学习在生物学数据处理和建模中应用的研究,以第一作者和通讯作者在Nature Protocols, Bioinformatics, BMC Bioinformatics,PLoS ONE 等杂志发表生物信息学的算法文章5篇,并作为主要的数据分析人员贡献了Nature, Nature Communications等多篇论文的数据的分析。