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计信院前沿学术报告(2017-11-11)

发布时间:2017-11-06 来源:本站原创 作者:本站编辑   浏览次数:

CCF Bioinformatics走进西南大学系列报告会

CCF-BIO Series Lectures

西南大学·重庆

2017年11月11日(星期六)上午9:00-12:00

西南大学第25教学楼0114(一楼大报告厅)

报告会主题基于大数据机器学习的生物数据智能分析

“CCF-BIO走进西南大学”活动是中国计算机学会(CCF)生物信息学专业组为更好地推动生物信息学与信息科学等学科之间的交叉,促进多学科领域学者间的交流与合作,更好的提升我国生物信息学研究水平,在全国范围内的高校、科研院所等开展的“CCF-BIO走进高校系列报告会活动”之一。本活动将于2017年11月11日在西南大学25号教学楼1320室举行,届时湖南大学信息科学与工程学院骆嘉伟教授、中南大学信息科学与工程学院李敏教授、陕西师范大学计算机科学学院雷秀娟教授将到会报告。欢迎相关领域的老师、学生、其他有兴趣者参加!

报告会程序

9:00   报告会开始

特邀讲者:骆嘉伟 博士,湖南大学信息科学与工程学院教授

演讲题目:基于生物网络的疾病相关miRNA及模块识别方法

特邀讲者:雷秀娟 博士,陕西师范大学计算机科学学院教授

演讲题目:群智能优化算法及其在生物信息学中的应用

特邀讲者:李敏 博士,中南大学信息科学与工程学院教授

演讲题目:基因组序列组装方法

12:00  报告会结束

联系人:王峻 博士,西南大学计算机与信息科学学院副教授,电话: 023-68254396, kingjun@swu.edu.cn

        余国先 博士,西南大学计算机与信息科学学院副教授,电话:023-68254396, gxyu@swu.edu.cn

 

特邀讲者:骆嘉伟 教授

   博士,湖南大学信息科学与工程学院教授,博士生导师;CCF大数据专委会委员,CCF生物信息学专业组委员,湖南省计算机学会常务理事。主要从事数据挖掘、智能与生物信息处理方面的研究。主持在研和完成国家自然科学基金、国家发改委重大项目子项、省部级研究课题等10余项。近年来,在Bioinformatics、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics等国内外重要学术期刊、国际会议上发表SCI/EI收录论文60余篇。

报告主题:基于生物网络的疾病相关miRNA及模块识别方法

报告摘要:随着生物知识的不断积累和多层次组学数据的涌现,复杂疾病的研究模式扩展到对分子之间相互形成的生物分子网络的系统分析。本报告主要介绍融合多种组学数据构建异构生物网络方法,分析不同生物分子相互作用网络和miRNA 协同调控网络的拓扑特性和功能特性,以复杂疾病作为分析的主要对象,借助数据挖掘和机器学习,开展复杂疾病相关的miRNA预测及调控模块识别方法研究,从而探索复杂疾病的发生发展机理。

 

特邀讲者:雷秀娟 教授

   博士,教授,博士生导师,陕西师范大学计算机科学学院副院长。任陕西省计算机学会理事、中国计算机学会生物信息学专业组首批委员、中国人工智能学会生物信息与人工生命专委委员、中国计算机学会理论计算机科学专委委员及多个国际会议程序委员会委员及分会主席。担任国家自然科学基金、中国博士后科学基金、国家公派高级研究学者及访问学者等项目的通讯评审专家。主持国家自然科学基金2项、教育部留学回国人员科研启动基金1项、陕西省自然科学基金1项、陕西省工业科技攻关项目1项。科学出版社出版专著1部《群智能优化算法及其应用》,在John Wiley & Sons, Inc.和IGI Global分别出版图书章节。发表研究论文60余篇,其中SCI二区论文8篇。获国家发明专利1项,软件著作权14项。研究方向:智能计算、生物信息计算。

报告主题:群智能优化算法及其在生物信息学中的应用

报告摘要:近些年,群智能优化算法成为智能计算和人工智能研究中的热点,它们已经应用渗入到诸多领域。在报告中,我将对这些智能优化算法(如PSO, ACO, ABC, BFO, GSO, FOA, FA和FPA等)进行介绍。然后我将细述我们在群智能优化算法在函数优化、聚类分析、蛋白质复合物挖掘和关键蛋白质检测等特定领域问题上的研究工作。同时我还将展示部分实验结果并证明群智能优化算法在这些领域问题上的可行性和效果。

 

特邀讲者:李敏 教授

   中南大学信息科学与工程学院教授、博士生导师。2016年NSFC优秀青年基金获得者。主要从事生物信息学与数据挖掘研究,在Bioinformatics、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、Proteomics、Methods等上发表SCI期刊论文70余篇,ESI Top1%高引论文7篇。担任国际期刊Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences、IJBRA的编委,IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 、Neurocomputing、Complexity、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Current Bioinformatics等的客座编委。2011年被确定为湖南省青年骨干教师培养对象,2012年获得教育部新世纪优秀人才资助,主持国家及省部级项目七项。曾获茅以升科研专项奖及教育部自然科学奖(二等奖)各1项。

报告主题基因组序列组装方法

报告摘要序列组装是基因组学研究中最基础,也是最重要且非常复杂的问题。本报告基于第二代测序技术产生的双端读数,从读数的Insert size分布等特征出发探讨基因组序列组装中几个重要问题,包括基因组contig构建、scaffolding和gap填充等。最后探讨随着三代测序技术的发展,基因组序列组装的挑战与机遇。

联系人:王峻 副教授

   工学博士,副教授,硕士生导师。近年来,在国际刊物和会议上发表科研论文(SCI/EI)40余篇。作为负责人主持中央高校基本科研业务经费学科团队项目一项,已完成国家自然科学基金(61101234),教育部中央高校基本科研业务经费重点项目和博士启动项目各1项。参与863国家级项目1项,国家自然科学基金项目5项。受邀担任多个SCI期刊和国内学报的审稿人。